FlowJo流式数据分析基础——常见术语

FlowJo,由斯坦福大学Leonard Herzenberg实验室在90年代推出的流式数据分析软件，因其强大功能和易用性而备受科学家和实验室青睐，成为各类高影响力期刊中引用率极高的工具。当我们使用FlowJo进行数据分析时，一些术语至关重要。首先，了解参数图至关重要：

1.1 一维直方图 (Histogram): 单个细胞的单参数测量数据通过统计分布，以直方图呈现。横轴是荧光或散射光信号强度，线形或对数显示；纵坐标则表示细胞数量。

1.2 二维散点图 (Dot Plot): 两个参数的二维图，横纵坐标同样表示荧光或散射光强度，用于多参数数据的分析。

1.3 其他参数图：如密度图和等高线图。

接着是门（Gate）的使用，有多种形式：

2.1 门的定义：区域、标记和十字形等。门的组合包括and、or、not操作。

2.2 定义门的方法：通过转换标记成门、四边形转门等操作。

在数据统计方面，常用百分比和荧光强度(MFI)：

(1)百分比表示细胞在样本中的占比。

(2)荧光强度(MFI)与细胞表面受体数量相关，如Median值对应164.74时，表示正相关。

对于数据可视化，FlowJo支持峰图和点图的叠加，以及模拟分析，如细胞增殖、细胞周期和剂量效应分析。