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北京大学化学与分子工程学院设有以下专业：
1. 化学 - 理学学士
2. 材料化学 - 理学学士
3. 应用化学 - 理学学士
4. 核化工与核燃料工程 - 工学学士
5. 化学生物学
6. 分子科学与工程
7. 能源化学
8. 化学测量学与技术
9. 资源化学
学生入学后，在第一学期末可以根据自己的兴趣和志向选择进一步学习的方向。
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