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上海交通大学拥有多个研究院，以下是一些主要的研究院及其简介：
上海交大密西根学院巴黎卓越工程师学院
上海交大-南加州大学文化创意产业学院
中欧国际工商学院中英国际低碳学院研究院
基础研究系统生物医学研究院
自然科学研究院
能源研究院
空天科学技术研究院
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航空发动机研究院
燃气轮机研究院
上海智能制造研究院
医疗机器人研究院
医学影像先进技术研究院
人工智能研究院
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